Изначально это храм должен был стоять на Васильевском острове, но строительство затянулось и было решено переехать на более дешевую землю.Но из-за смерти митрополита здание так и осталось деревянным, хоть и перешло под управление Синода. Следующий за ним настоятель был крайне нетробователен к условиям комфорта, поэтому он заботился только о расширении прихода. Лишь спустя 10 лет благодаря знакомству архитектора Косякова с новым митрополитом это неказистое здание с кучей пристроек превратилось в то произведение искусства, которое мы можем наблюдать и до сих пор. К 1900 году были полностью закончены иконостасы, главный алтарь с хорами и жилые помещения. Здание выстроено в старорусском стиле и облицовано песчаником и кирпичом. После Октябрьской революции его постигла участь большинства храмов-монахи из келий были выселены, а прихожане-арестованы, само здание превращено в склад Ленинградского морского порта. Лишь в 1991 году подворье было вновь передано в бессрочное пользование и только в 2013 году с помощью народных средств и команды реставраторов-энтузиастов все внутренние и внешние работы были закончены.