Это единственный музей в России, целиком посвященный подводному флоту.Изначально он базировался на Литейном проспекте и вся экспозиция помещалась в квартире, но благодаря первому директору и группе юных следопытов ”Поиск” коллекция была значительно расширена. В 1997 году по распоряжению губернатора Санкт-Петербурга было выделено здание рядом с Богословским кладбищем, где и был похоронен знаменитый подводник. Чуть позднее рядом с музеем была установлена рубка с настоящей подлодки, в которой все детали рабочие и можно зайти внутрь,почуствовать себя частью экипажа. Сейчас коллекция размещается в пяти залах и насчитывает более 13 тысяч экспонатов, начиная от макетов деревянных субмарин и заканчивая ультрасовременными атомными подводными лодками.